Timeline Stories

• IrsiCaixa aísla en los laboratorios de bioseguridad de nivel 3 del Centro de Medicina Comparativa y Bioimagen (CMCiB) la variante Delta del SARS-CoV-2 –descrita por primera vez en la India – para poder estudiarla. El virus se obtiene a partir de una muestra de frotis nasal de pacientes con COVID-19. Una vez demostrado con secuenciación que la variante Delta es la causante de la infección, el equipo investigador del grupo Patógenos, Inmunidad, Señalización y Terapias Aplicadas (PISTA) de IrsiCaixa, ha podido aislar el virus y hacerlo crecer en el laboratorio. Este mismo procedimiento se está haciendo con una variante que se detectó por primera vez en Colombia, y que empieza a ser frecuente en Cataluña. Esta variante, aunque no está en el grupo de las variantes preocupantes (en inglés variants of concern), formado por las variantes delta, alfa, beta y gamma que ya hemos aislado y evaluado, sí que se considera una variante de interés de la que se debe hacer un seguimiento.
• El grupo PISTA está haciendo un seguimiento de estas variantes consideradas preocupantes y sigue evaluando cómo funcionan los antivirales contra estos virus aislados a partir de pacientes en el laboratorio.
• Se han producido pseudo-virus de la variante Delta, es decir, virus artificiales con la misma secuencia genética que la variante detectada por primera vez en la India. El equipo del grupo de Viología e Inmunología Celular (VIC) ha podido comprobar que estos virus artificiales contienen el mismo material genético y que son infecciosos.
• Han probado la eficacia de los anticuerpos biespecíficos que se están desarrollando en el marco del consorcio CBIG con virus artificiales y obtenidos de pacientes de la variante Delta. De este modo han determinado que estos anticuerpos sintéticos que reconocen dos regiones distintas del virus siguen siendo funcionales ante la variante Delta, igual que con el resto de variantes consideradas preocupantes.
• Para poder hacer estudios con la variante Delta en modelos animales, primero se tiene que caracterizar la enfermedad de COVID-19 con este virus. Durante el mes de junio se ha hecho esta caracterización para poder tener resultados veraces sobre la efectividad de los anticuerpos y vacunas contra estas variantes.
  Durante este estudio se observa que la variante Delta, a diferencia de la original, puede infectar ratones que no contienen el receptor ACE2 humano, encargado de capturar el SARS-CoV-2 en las células pulmonares, hecho que demuestra un cambio en el rango de especies que puede infectar el virus.
• Respecto a la vacuna contra la COVID-19, el consorcio CBIG está generando cambios en los prototipos de vacuna para tener un amplio abanico de posibilidades. En Junio se obtienen nuevos inmunógenos, es decir, nuevos prototipos, y se testan en modelos animales. Por otro lado, se evalúa la eficacia de la vacuna contra la nueva variante Delta.

• Alrededor del 8% de las personas que pasan la COVID-19 no generan anticuerpos aun haber sido infectadas por SARS-CoV-2. Para entender cómo combaten el virus estas personas, IrsiCaixa ha comparado la respuesta inmunitaria de las personas que superan la COVID-19 con anticuerpos respecto la de aquellas que no los generan. El Instituto ha podido demostrar que, en este segundo contexto, las células T del sistema inmunitario son muy eficaces, ya que pocas son suficientes para evitar la severidad de la enfermedad y, además, son capaces de reconocer proteínas tanto del exterior como del interior del virus. El artículo, compartido en abierto en el repositorio bioRxiv, identifica características de las células T que ayudarán a detectarlas y hacer un seguimiento de la inmunidad celular contra el SARS-CoV-2. Los resultados destacan la elevada importancia de este tipo de inmunidad para combatir la COVID-19 y, además, servirán de guía para incluirla en el diseño de futuras vacunas.
• Un buen control de la pandemia pasa por una revisión exhaustiva de la prevalencia de las diferentes variantes del SARS-CoV-2. Para conseguirlo, el Instituto de Investigación del Sida IrsiCaixa, ha creado una nueva página web (http://covidtag.paseq.org/) que proporciona una visión detallada de cómo las variantes del SARS-CoV-2 van evolucionando en las diferentes comunidades autónomas españolas. La herramienta, llamada CovidTag, es accesible al público y permite obtener el número total de muestras secuenciadas en cada región. La actualización semanal de la información es posible gracias a la base de datos de GISAID, una plataforma que ofrece datos genómicos globales relacionados con el SARS-CoV-2.
• IrsiCaixa publica en BioRxiv un artículo que caracteriza la función de dos tipos de células del sistema inmunitario, llamados macrófagos y células dendríticas, en la infección por el SARS-CoV-2. Estas células tienen un receptor llamado Siglec-1, que tiene un papel importante en otras infecciones, como la del VIH o el Ebola. Por ello, se quería evaluar qué función tenía este receptor en el caso del SARS-CoV-2. Los resultados han demostrado que en los macrófagos Siglec-1 permite la entrada del virus y desarrollar una cascada de moléculas inflamatorias, que en muchos casos conllevan una COVID-19 más severa. En el caso de las células dendríticas, el receptor permite capturar el SARS-CoV-2, almacenarlo dentro de la célula y transportarlo hasta el pulmón, donde hay las células diana que una vez infectadas causarán la COVID-19.

• Gracias a la financiación de #YoMeCorono, IrsiCaixa empieza un estudio para entender cómo se comporta el SARS-CoV-2 en mujeres embarazadas que en el momento de dar a luz eran positivas por COVID-19. Para ello, se recogieron muestras de distintos tejidos de las voluntarias y se evaluó la presencia de virus. Entre estos tejidos está el calostro, la placenta, las heces, entre otros.
• #YoMeCorono participa en proyectos para poder encontrar nuevas dianas que permitan atacar el virus. Una de ellas son los exosomas, compartimentos envueltos por una membrana que circulan por el plasma y pueden contener partes de virus. Por ello se han analizado plasmas de pacientes con COVID-19 para encontrar exosomas y revelar qué partes del virus están presentes en estos exosomas. Además, se han puesto a punto dos tecnologías para mejorar el rendimiento del aislamiento de exosomas del plasma.

Tras la celebración de una primera prueba piloto en la Sala Apolo de Barcelona, en la que se comprobó la efectividad de las medidas de cribaje y control con tests de antígenos para evitar la transmisión del virus en entornos cerrados con gran afluencia de personas, se celebra un segundo estudio observacional en el concierto del Palau Sant Jordi con Love of Lesbian, con más de 5.000 personas.

Después de comprobar que el SARS-CoV-2 no puede infectar las células del sistema inmunitario que se originan en la médula ósea, llamadas células mieloides, IrsiCaixa está estudiando cómo se activan estas células que, en estadios avanzados de la COVID-19, pueden iniciar una respuesta que empeora la sintomatología de algunos pacientes. Además, se está investigando cómo responden estas células del sistema inmunitario al SARS-CoV-2 en los estadios iniciales de la infección y si pueden contribuir a la replicación viral.

Análisis de los datos de la inmunidad de personas que pasaron la COVID-19 hace un año para entender cuánto dura la protección contra el SARS-CoV-2. Los primeros resultados apuntan a que no todas las personas que pasaron la infección por SARS-CoV-2 durante la primera ola mantienen los anticuerpos neutralizantes contra el virus, aunque la gran mayoría de los que pasaron por una hospitalización mantienen una respuesta inmunitaria estable. Por otra parte, también se ha estudiado cuál es la protección que tienen actualmente estas personas ante las variantes del virus detectadas en Sudáfrica y Brasil.

Se ha finalizado la fase de reclutamiento de pacientes del ensayo clínico internacional INSIGHT-013-ITAC, que cuenta con la participación de Roger Paredes. El ensayo busca determinar si añadir inmunoglobulinas hiperimmunes al tratamiento estándar de la COVID-19 es beneficioso.

Validación definitiva de un test rápido de antígenos que ha mostrado mucha especificidad y sensibilidad, comercializado por la empresa Nesapor.

Inicio del estudio de la respuesta inmunitaria de personas con un sistema inmunitario debilitado que han recibido la vacuna. Este estudio incluye personas que han pasado por un trasplante de riñón o de médula ósea y otros con tumores sólidos. Se está llevando a cabo en colaboración con el Hospital Clínico y el Instituto Catalán de Salud (ICO).

Crece el grupo de estudio de personas con COVID-19 persistente. Las primeras investigaciones sugieren las afectaciones en el nervio vago y las microafectaciones en el sistema cardiovascular como posibles causas de algunas dolencias en pacientes con COVID-19 persistente. Se consolida la Unidad de Covid Persistente en estrecha colaboración de la Fundación, IrsiCaixa y el Hospital Universitario Germans Trias i Pujol.

 

Producir anticuerpos en el laboratorio es una potencial herramienta para proporcionar inmunidad inmediata a pacientes con COVID-19 pero también a aquellas personas que la vacuna no haya tenido el efecto deseado. IrsiCaixa está llevando a cabo un proyecto, liderado por Julià Blanco, para desarrollar estos anticuerpos sintéticos en el laboratorio. Durante febrero, se ha perfeccionado su diseño con el objetivo de mejorar su producción y mantener su actividad para bloquear el SARS-CoV-2. Este nuevo prototipo pasa a ser la cuarta generación de anticuerpos. Por otro lado, se observan buenos resultados cuando se administran los anticuerpos sintéticos diseñados durante la primera generación por vía intranasal, una opción que permitiría utilizar estas moléculas como profilaxis para el SARS-CoV-2.

IrsiCaixa está trabajando en el aislamiento de las variantes del SARS-CoV-2 detectadas en Inglaterra, Sudafrica y Brasil. Estos virus permitirán probar, en el laboratorio, la eficacia de fármacos antivirales.

El Can Ruti Sequencing Hub, un consorcio formado por IrsiCaixa, el Hospital Germans Trias i Pujol, el Instituto de Investigación Germans Trias i Pujol, ha sistematizado el proceso de secuenciación del genoma completo del SARS-CoV-2 y secuencia 200 muestras a la semana.

El ensayo clínico internacional ACTIV-3, que cuenta con la participación del médico de IrsiCaixa y FLS Roger Paredes, confirmó que los anticuerpos monoclonales BRII, GSK y LY-CoV555 no añaden ningún efecto beneficioso en el tratamiento estándar de los pacientes hospitalizados.

Comienzan los estudios con los virus artificiales diseñados en el laboratorio y que contienen la partícula de la espícula (proteína S de spike en inglés) con las mismas mutaciones que la variante sudafricana y brasileña.

Sigue la identificación y caracterización de la inmunidad celular, una respuesta protectora a largo plazo protagonizada por las células T del sistema inmunitario. En este proyecto se ha evaluado las respuestas de las células T en 13 individuos que pasaron una infección moderada pero que habían generado anticuerpos, otro tipo de respuesta inmunitaria más tardía a la celular. Los resultados apuntan a que un 60% de esta respuesta va dirigida a la proteína S (Spike) del virus. Por otra parte, también se está estudiando cómo es esta respuesta en las personas que, a pesar de haber pasado la infección por SARS-CoV-2, no han generado anticuerpos contra el virus. Para poder escalar la evaluación de la respuesta celular a más individuos, el grupo Evasión Inmunitaria y Vacunas (VIRIEVAC) de IrsiCaixa está desarrollando un test para poder detectar este tipo de defensas y estudiar a qué proteínas del virus van dirigidas.

El virus muta para adquirir ventajas evolutivas que pueden comprometer los avances científicos en el campo de la COVID-19. Es por ello que IrsiCaixa incrementa los esfuerzos de secuenciación, una herramienta que permitirá controlar mejor la epidemia, hacer un seguimiento de las variantes y detectar la aparición de nuevas mutaciones.
Gracias a las técnicas de secuenciación, IrsiCaixa ha demostrado que un total de 11 muestras, provenientes de pacientes de la comarca del Bages y con sospecha previa de haber adquirido la cepa británica del SARS-CoV-2, pertenecen a esta nueva variante. Se implementa el Campus Can Ruti sequencing hub, formado por IrsiCaixa, los servicios de Microbiología y Enfermedades Infecciosas del Hospital Germans Trias i Pujol y el servicio de Genómica Translacional del IGTP, que pretende secuenciar 200 muestras de pacientes con COVID-19 a la semana.

IrsiCaixa publica en abierto los resultados de un estudio en el que evalúan 72 fármacos y confirman que de entre ellos la Aplidina es el más potente bloqueando el virus, incluso en comparación con el Remdesivir, el fármaco más ampliamente usado en la clínica actualmente.

Publicación en la revista Med de los resultados del seguimiento de la respuesta inmunitaria de pacientes que han pasado la COVID-19 durante 6 meses.

La cohorte King llega a los 400 pacientes reclutados y detecta el segundo caso de reinfección por SARS-CoV-2 que desarrolla una clínica grave.

Los participantes de la cohorte CoronAvi@s reciben las vacunas aprobadas por la Unión Europea y se empieza el estudio de su respuesta inmunitaria frente a las vacunas. De este modo podremos entender la capacidad de respuesta de este colectivo, que, debido a la edad, suele tener menor capacidad de responder adecuadamente a las vacunas, y así poder buscar soluciones para mejorar su protección frente al virus.

Se empieza el estudio de la variante británica del virus en el laboratorio mediante pseudovirus, virus artificiales que contienen las mismas mutaciones que la variante del SARS-CoV-2 circulante. El objetivo es evaluar la eficacia de los anticuerpos naturales o producidos por vacunas frente a esta variante.

Se testan en el laboratorio los anticuerpos sintéticos biespecíficos de tercera generación, unos anticuerpos artificiales que podrían unirse al virus e impedir su entrada en las células. Estas moléculas muestran una capacidad para bloquear el SARS-CoV-2 cien veces mayor que las diseñadas en la primera generación.

Inicio del ensayo clínico para determinar la eficacia del CPC, componente químico presente en los colutorios para reducir la capacidad de transmisión del virus en pacientes.

Publicación del estudio sobre el riesgo de transmisión según la carga viral de pacientes con COVID-19 en Catalunya. A mayor carga viral mayor es el riesgo de contagiar y también de progresar clínicamente.

Estudiamos la especificidad y sensibilidad de los tests rápidos de antígeno por coronavirus de cinco marcas diferentes en comparación con la técnica de referencia PCR y confirmamos su utilidad como herramienta de cribaje masivo.

Para entender la evolución de la pandemia y valorar la posibilidad de revacunaciones, es esencial estudiar cuánto dura la inmunidad frente al SARS-CoV-2. IrsiCaixa demuestra que los niveles de anticuerpos neutralizantes, es decir, con efecto protector contra el virus, se mantienen a lo largo de los seis meses que ha durado el estudio. Sin embargo, un 40% de los pacientes asintomáticos tienen los niveles de anticuerpos neutralizantes muy bajos, hecho que cuestiona si estarían inmunizados frente a una reinfección.

IrsiCaixa, en colaboración con Dentaid Research Center, demuestra que el cloruro de cetilpiridinio (CPC), componente químico presente en algunos colutorios, es capaz de reducir unas 1000 veces la capacidad de infección del SARS-CoV-2 en estudios llevados a cabo en células en el laboratorio. A partir de estos resultados se plantea un ensayo clínico para valorar su eficacia en pacientes, liderado por la Fundación Lucha contra el Sida y las enfermedades infecciosas (FLSida).

Llevamos a cabo, junto con el grupo Primavera Sound, el ensayo clínico PrimaCoV, para evaluar la eficacia del cribado de casos positivos por COVID-19 con test rápido de antígenos en un concierto con 500 personas.

Se diseñan los anticuerpos sintéticos biespecíficos de tercera generación para mejorar su eficacia e incluir su función contra todas las variantes conocidas del SARS-CoV-2 y potenciales variantes que puedan emerger.

IrsiCaixa empieza a trabajar en las instalaciones del Centro de Medicina Comparativa y Bioimagen (CMCiB) con virus SARS-CoV-2 obtenidos directamente de pacientes, una alternativa que substituye a los virus artificiales ampliamente usados en el laboratorio. Este avance logístico permite realizar estudios mucho más realistas y similares al proceso de infección. Hasta el momento, el trabajo con “virus reales” se hacía en los laboratorios del Centre de Recerca en Salut Animal IRTA-CReSA, con quien IrsiCaixa mantiene una estrecha colaboración.

Finalizamos la primera visita y el reclutamiento de la cohorte CoronAvi@s, un proyecto que ha conseguido contar con un total de 100 personas mayores que viven en residencias y que han superado la COVID-19. El estudio de la respuesta inmunitaria de estas personas permitirá buscar soluciones específicas para este colectivo, que es el más afectado por la pandemia.

Investigadores de IrsiCaixa y el Instituto de Biología Evolutiva (IBE) inician un proyecto con organoides de pulmón y cerebro, miniórganos diseñados en el laboratorio, que permitirán simular una infección por el SARS-CoV-2 lo más real posible. El objetivo del proyecto es estudiar cómo este virus afecta a los órganos humanos y la efectividad de varios fármacos para frenar la infección.

Se aíslan los anticuerpos de los animales vacunados con el prometedor diseño de vacuna de YoMeCorono para poder caracterizarlos y la efectividad que tienen para bloquear el SARS-CoV-2.

Iniciamos el estudio sobre la eficacia clínica y analítica del Test Rápido de Diagnóstico de Antígeno COVID-19 Panbio.

Se inicia un proyecto para determinar qué proteínas celulares son esenciales para permitir o bloquear la replicación del SARS-CoV-2 y evaluar posibles fármacos dirigidos a estas proteínas. En colaboración con la Universitat Pompeu Fabra (UPF) se pretende identificar los factores del huésped esenciales para el ciclo de infección del SARS-CoV-2. Una vez identificados, el equipo investigador pretende probar los fármacos que existentes en el mercado contra estos factores para la inhibición de la infección viral.

Se han iniciado estudios sobre la función del receptor ACE2 y la respuesta inmune innata en la infección por SARS-COV2, el papel de la inmunidad entrenada mediada por BCG y/o otros estímulos y la evaluación de la patogénesis por SARS-Cov2 mediante modelos pre-clínicos complejos a partir de tejidos humanos.

Inicio del estudio CONVERT que testará la eficacia de plasma de pacientes convalecientes para tratar la COVID-19 en pacientes recientemente infectados.

Se ha demostrado que el tratamiento con altas dosis de inmunoglobulinas intravenosas (IVIG) reduce los niveles de citoquinas que están anormalmente aumentados en los pacientes COVID-19. También se ha demostrado que las IVIG reducen los niveles de proteínas implicadas en la activación del sistema inmunitario a través del LPS (componente mayoritario de la membrana externa de las bacterias) y bloquea la activación del complemento. Estos resultados aportan importante información acerca del mecanismo de acción de las IVIG en los pacientes COVID-19.

Se están analizando los datos obtenidos del estudio CIRCUS cuyo objetivo es ver cómo afecta la carga viral inicial al desarrollo de anticuerpos neutralizantes contra el virus.

El equipo de Julià Blanco ha deteminado los niveles de anticuerpos neutralizantes contra la spike del SARS-CoV-2 y las respuestas celulares a las proteínas Spike y Nucleoproteina.

Desarrollo de pruebas diagnósticas para medir la presencia de auto anticuerpos contra interferón alfa y omega, así como en otros marcadores genómicos relacionados ahora con la inmunidad adquirida.

Para determinar a qué partes del SARS-CoV-2 van dirigidos los anticuerpos neutralizantes –pequeñas flechas esenciales para bloquear el virus–, IrsiCaixa ha iniciado estudios para poder aislarlos y caracterizarlos. Para ello, se utilizan células de personas que han pasado la COVID-19 y han generado muchos anticuerpos neutralizantes, en concreto linfocitos B. Estos anticuerpos aportarán importante información acerca de los epítopos neutralizantes (las regiones en el virus contra las que van dirigidos los anticuerpos que bloquean eficazmente el virus) y por tanto de los mecanismos de protección frente a la infección. Esperamos poder usar toda esta información para mejorar las vacunas contra la COVID-19.

En relación a la vacuna, durante este mes hemos avanzado en la producción y purificación de nuevos inmunógenos basados en modificaciones de la proteína S. Con estas modificaciones intentamos mejorar la capacidad de estas proteínas para generar anticuerpos neutralizantes protectores. Una vez purificados, hemos comenzado a probarlos en modelos animales. Los primeros resultados son muy prometedores. Esperamos cerrar estos experimentos a finales de Octubre/inicios de Noviembre, cuando sabremos si realmente hemos mejorado la capacidad de producir anticuerpos neutralizantes con estos nuevos inmunógenos.

Se ha concluido el análisis de la actividad antiviral frente a SARS-CoV-2 en sistemas de cultivo celular en el laboratorio de 72 compuestos aprobados para uso en pacientes y 28 posibles combinaciones de fármacos. Nuestra estrategia se ha centrado en el estudio de compuestos aprobados para el uso clínico, puesto que son los candidatos ideales para evaluar en ensayos clínicos con pacientes, algo que ya se está haciendo en la unidad de enfermedades infecciosas del Hospital Universitario Germans Trias i Pujol con aquellos compuestos que hemos priorizado. Mientras que algunos fármacos cómo el Aplidin son muy potentes in vitro, otros antivirales usados en el campo del VIH tales como Truvada y Kaletra no tienen un efecto significativo sobre el nuevo coronavirus.

Se ha terminado el análisis de una serie de casos de pacientes hospitalizados por COVID-19 que fueron tratados con altas dosis de inmunoglobulinas intravenosas para evitar que desarrollaran un síndrome respiratorio grave. Los primeros cinco pacientes tratados con esta terapia redujeron sus marcadores de inflamación, mejoraron sus niveles de linfocitos y recuperaron los niveles de oxígeno. No requirieron ingreso en UCI y fueron dados de alta precozmente.

Se ha puesto a punto el modelo de infección de SARS-CoV-2 con ratón transgénico y hámster y hemos creado un modelo para poder testar la inmunogenicidad en del cerdo.

Se ha demostrado que un gato de compañía de un paciente afectado por el covid-19 se había infectado a través de su dueño. Los gatos pueden infectarse por el SARS-CoV-2 pero no se ha descrito hasta ahora que estos animales puedan transmitir la enfermedad a las personas.